CancerCODE

揭露新的癌症相关性,发掘新的药物反应标志物并生成报告指导治疗

揭露新的癌症相关性,发掘新的药物反应标志物并生成报告指导治疗

CancerCODE解释系统使得临床医生和研究人员能够扫描源于肿瘤/胚系的突变和结构变异的WGS数据。该系统能够促进癌症相关变异的鉴别,并能够迅速与其他来源的基因组数据(包括array-CGH和RNA-seq)进行对比。

使用简便

我们的系统设计对于临床医生和研究人员非常直观,不仅能快速执行标准分析,也可提供生物信息学平台解决方案,更能为更高级的分析提供灵活的工具。我们的系统在解析数据过程中利用不同群体等位基因频率的数据库获得高灵敏度和特异性,并拥有并行方式运行MuTect和Varscan2的能力以及对于可操作性基因集合的使用(例如COSMIC和TCGA)。

快速分析

通过高效率的工作流程节省时间,我们的系统可以对原始序列进行即时可视化,以方便确定变异。在系统内,用户可以将临床和研究数据集轻松切换,并生成临时报告或审查最终报告。

可操作性和自定义报告

得益于领先的基因组和表型数据专有知识库,我们的研究系统已被证实能够高效鉴定新变异体,其中包括4000万个独特的已经过验证的变异。这些特性有助于确定可用来制定治疗方案的变异,对此可以使用集成的NofOne内容创建自定义报告。这些报告能够将可操作的癌症基因突变与FDA批准或研究中的治疗进行匹配,并为临床试验选择特定患者提供建议。

即时可视化

即时可视化

原始序列数据

端到端能力

我们提供从队列管理到测序与二级分析的全套产品和服务。并在与CancerCODE系统整合之时,提供独特且全面解决方案。

整合和协作

通过与现有系统整合,利用我们的生态系统与世界各地的同行、机构合作。利用全分辨率数据而无需移动大文件。将所有优先序列变异体与您所在机构及合作机构中所有测患者的测序结果进行交叉匹配,构建您自己的知识库。

灵活的数据存储模式

通过在云端运行系统,仅需支付所需的计算时间和存储费用,便可获得灵活的可扩展性、一流的安全性和合规性的保障(由DNAnexus支持)。

特性



  • 精准比较肿瘤与胚系WGS和WES数据
  • 运行Mutect和Varscan2算法,并利用冰岛和公共等位基因频率提高肿瘤特异性突变分析的灵敏度和特异性
  • 在肿瘤和胚系样品鉴别LOH、SNP、lndel、重组突变和CNV
  • 结合COSMIC和TCGA数据进行联合发掘并查询可操作的基因探针集
  • 立即访问比对上的序列以确认体细胞突变或胚系突变
  • 使用RNA-seq和arrayCGH数据轻松比较结果
  • 确定复发癌症中的耐药性驱动突变(治疗前、后肿瘤序列分析对比)
  • 识别治疗应答者与无应答者
  • 比较肿瘤特异性与存活变体
  • 报告与药物、免疫治疗和化疗敏感性或耐药性相关的基因和变异注释